Рейнхард Гейдрих и Герман Франк в одном из пражских театров, 8 октября 1941 года.

Сразу же по прибытию в Прагу, Гейрих стал немедленно "закручивать гайки", начав с председателя правительства протектората генерала бывшей чехословацкой армии Алоиза Элиаша. Еще в 1940 году Гейдрих по каналам СД получил сведения, что пятидесятилетний генерал установил связи с лондонским эмигрантским правительством, он потребовал его ареста, но натолкнулся на "непонимание" Нейрата и судебных властей. Теперь Гейдрих действовал стремительно: в день своего назначения он сместил и арестовал Элиаша, 28 сентября по приговору военно-полевого суда были расстреляны генералы Йозеф Била и Гуго Войт. 29 сентября Элиашу было предъявлено обвинение, и 1 октября он был приговорён к смертной казни.