С 4 ноября 1926 года СС было поручено хранить священный флаг Третьего Рейха - Blutfahne ("кровавое знамя"). Это знамя нацисты несли во время мюнхенского путча, когда по ним полиция открыла огонь. Знамя оказалось забрызганным кровью, что позволило сделать из него святыню. Знаменосцем "кровавого знамени" стал ветеран Первой Мировой войны (Галлиполийская компания) и участник "битвы за Кобург" (1922 год), труппфюрер СС Якоб Гриммингер (Grimminger) из мюнхенского отделения СС, он же и оставался знаменосцем на протяжении всей своей службы в СС. В последний раз "кровавое знамя" продемонстрировали публике в апреле 1944 года во время похорон Адольфа Вагнера, гауляйтера области Мюнхен-Верхняя Бавария. К тому времени Гриммингер был уже в звании штандартенфюрера СС - должность знаменосца партийной реликвии весьма облегчала продвижение по службе.

Каждый полк Аппарата СС (Allgemeine-SS) располагал своим знаменем - Feldzeichen или Standarte. Штандарт внешне напоминал штандарт римских легионов и представлял собой древко, увенчанное орлом сидящим на венке со свастикой. Под венком располагалась прямоугольная чёрная пластина с названием полка (или названием местности его формирования) на лицевой стороне и аббревиатурой NSDAP на обратной. Под пластиной подвешивалось красное шелковое полотнище штандарта со стоящей свастикой на фоне белого круга. Выше и ниже свастики проходила надпись "Deutschland Erwache" ("Германия, проснись"), вышитая серебряной нитью. На обратной стороне полотнища помещалась надпись "Naz. Soz. Deutsche Arbeiterpartei - Sturmabteilung". По краям полотнища шла красно-бело-черная бахрома. Штандарт СА отличался от штандарта СС только цветом пластины - серебряным, а не чёрным.

Когда численность отряда СС позволяла присвоить отряду статус полка, новоиспеченный полк получал свой Fieldzeichen. Вручение происходило в виде псевдорелигиозной церемонии, обычно проводимой в сентябре в Нюрнберге во время празднования очередной годовщины НСДАП. Во время церемонии Гитлер брал штандарты новых полков и касался ими "кровавого знамени", которое держал Гиммингер. Таким образом новые члены СС приобщались к "мученикам", погибшим во время "пивного путча".

Штандарт кавалерийских полков во многом походил на пехотный штандарт. Отличие заключалось в том, что полотнище подвешивалось к древку при помощи горизонтальной перекладины, под прямым углом присоединенной к древку. Кроме того, вместо пластины с названием части, кавалерийский штандарт имел в крыже черную нашивку (Fahnenspiegel), где помещалось изображение скрещенных пик и номер полка, вышитые серебром.

Каждый батальон СС имел собственное батальонное знамя (Sturmbannfahne). Батальонное знамя имело красное полотнище с большой катящейся свастикой на фоне белого круга. Край полотнища окантовывался серебристо-черным витым шнуром. В крыже знамени помещалась черная нашивка, где серебряной нитью был вышит номер батальона и полка (римской и арабской цифрой, соответственно). Большинство эсэсовский знамен и штандартов изготавливалось на берлинской фирме Fahnen-Hoffmann.

Командирские флаги (Kommando-flaggen) представляли собой жесткие вымпелы, укрепленные на флагштоках. Такие вымпелы носили на парадах, а из уменьшенные варианты крепили на крыльях штабных автомобилей. Вымпелы были квадратной, прямоугольной или треугольной формы, в зависимости от ранга командира, их изготавливали из черной или белой непромокаемой ткани с металлической нержавеющей нитью. В плохую погоду командирские флаги покрывали чехлом из прозрачного целлулоида. В каждом SS Oberabschnitte (основное территориальное отделение Аппарата СС) полагалось иметь один официальный флаг и один командирский флаг рейхсфюрера СС, которые использовались во время визитов Гиммлера. Существовали командирские флаги для начальников главных департаментов СС, командиров SS Oberabschnitte и Abschnitte, командиров полков, кавалерийских полков, батальонов, начальников складов и начальников инспекторатов, а также ведущих членов общества поддержки СС.